Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sim1Q61045 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sim1Q61045 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sim1Q61045 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sim1Q61045 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sim1Q61045 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sim1Q61045 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sim1Q61045 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sim1Q61045 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sim1Q61045 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sim1Q61045 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sim1Q61045 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sim1Q61045 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sim1Q61045 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sim1Q61045 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sim1Q61045 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sim1Q61045 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sim1Q61045 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sim1Q61045 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sim1Q61045 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sim1Q61045 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sim1Q61045 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sim1Q61045 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sim1Q61045 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sim1Q61045 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sim1Q61045 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sim1Q61045 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sim1Q61045 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sim1Q61045 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sim1Q61045 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sim1Q61045 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sim1Q61045 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sim1Q61045 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sim1Q61045 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sim1Q61045 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sim1Q61045 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sim1Q61045 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sim1Q61045 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sim1Q61045 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sim1Q61045 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sim1Q61045 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sim1Q61045 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sim1Q61045 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sim1Q61045 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sim1Q61045 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sim1Q61045 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sim1Q61045 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sim1Q61045 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sim1Q61045 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sim1Q61045 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sim1Q61045 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sim1Q61045 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sim1Q61045 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sim1Q61045 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Sim1Q61045 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sim1Q61045 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sim1Q61045 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms