Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
SkiQ60698 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
SkiQ60698 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
SkiQ60698 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
SkiQ60698 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
SkiQ60698 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
SkiQ60698 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
SkiQ60698 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
SkiQ60698 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
SkiQ60698 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
SkiQ60698 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
SkiQ60698 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
SkiQ60698 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
SkiQ60698 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
SkiQ60698 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
SkiQ60698 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
SkiQ60698 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
SkiQ60698 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
SkiQ60698 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
SkiQ60698 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
SkiQ60698 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
SkiQ60698 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
SkiQ60698 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
SkiQ60698 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,97■■■□□ 2,07
SkiQ60698 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
SkiQ60698 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
SkiQ60698 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
SkiQ60698 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
SkiQ60698 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
SkiQ60698 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,91■■■□□ 2,06
SkiQ60698 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
SkiQ60698 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
SkiQ60698 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
SkiQ60698 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
SkiQ60698 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
SkiQ60698 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
SkiQ60698 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
SkiQ60698 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
SkiQ60698 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,8■■■□□ 2,04
SkiQ60698 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
SkiQ60698 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
SkiQ60698 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,77■■■□□ 2,04
SkiQ60698 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,74■■■□□ 2,03
SkiQ60698 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
SkiQ60698 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,73■■■□□ 2,03
SkiQ60698 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
SkiQ60698 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
SkiQ60698 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,72■■■□□ 2,03
SkiQ60698 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
SkiQ60698 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
SkiQ60698 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
SkiQ60698 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
SkiQ60698 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
SkiQ60698 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
SkiQ60698 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
SkiQ60698 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
SkiQ60698 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
SkiQ60698 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
SkiQ60698 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
SkiQ60698 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
SkiQ60698 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
SkiQ60698 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
SkiQ60698 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
SkiQ60698 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
SkiQ60698 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,51■■□□□ 1,99
SkiQ60698 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
SkiQ60698 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
SkiQ60698 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
SkiQ60698 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
SkiQ60698 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
SkiQ60698 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
SkiQ60698 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
SkiQ60698 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
SkiQ60698 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
SkiQ60698 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
SkiQ60698 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms