Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ChukQ60680 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChukQ60680 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ChukQ60680 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChukQ60680 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChukQ60680 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChukQ60680 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ChukQ60680 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChukQ60680 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChukQ60680 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChukQ60680 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChukQ60680 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ChukQ60680 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChukQ60680 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChukQ60680 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ChukQ60680 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ChukQ60680 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ChukQ60680 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChukQ60680 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChukQ60680 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChukQ60680 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ChukQ60680 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChukQ60680 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChukQ60680 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ChukQ60680 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ChukQ60680 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChukQ60680 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ChukQ60680 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ChukQ60680 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChukQ60680 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChukQ60680 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChukQ60680 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChukQ60680 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChukQ60680 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChukQ60680 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChukQ60680 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChukQ60680 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChukQ60680 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ChukQ60680 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChukQ60680 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChukQ60680 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ChukQ60680 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChukQ60680 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ChukQ60680 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChukQ60680 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChukQ60680 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChukQ60680 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChukQ60680 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ChukQ60680 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChukQ60680 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChukQ60680 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChukQ60680 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChukQ60680 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ChukQ60680 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ChukQ60680 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ChukQ60680 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ChukQ60680 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChukQ60680 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChukQ60680 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChukQ60680 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChukQ60680 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChukQ60680 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChukQ60680 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChukQ60680 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChukQ60680 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ChukQ60680 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ChukQ60680 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ChukQ60680 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ChukQ60680 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChukQ60680 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChukQ60680 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChukQ60680 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChukQ60680 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ChukQ60680 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChukQ60680 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChukQ60680 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ChukQ60680 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChukQ60680 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChukQ60680 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChukQ60680 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms