Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1d2Q60674 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1d2Q60674 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1d2Q60674 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d2Q60674 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d2Q60674 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1d2Q60674 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1d2Q60674 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1d2Q60674 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr1d2Q60674 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1d2Q60674 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1d2Q60674 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1d2Q60674 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1d2Q60674 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1d2Q60674 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1d2Q60674 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1d2Q60674 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d2Q60674 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1d2Q60674 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1d2Q60674 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1d2Q60674 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1d2Q60674 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1d2Q60674 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d2Q60674 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1d2Q60674 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1d2Q60674 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d2Q60674 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1d2Q60674 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1d2Q60674 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1d2Q60674 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1d2Q60674 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1d2Q60674 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1d2Q60674 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms