Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc125Q5U465 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc125Q5U465 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc125Q5U465 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc125Q5U465 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc125Q5U465 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc125Q5U465 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc125Q5U465 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc125Q5U465 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc125Q5U465 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc125Q5U465 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc125Q5U465 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc125Q5U465 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc125Q5U465 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc125Q5U465 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc125Q5U465 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc125Q5U465 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms