Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bod1Q5SQY2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bod1Q5SQY2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bod1Q5SQY2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bod1Q5SQY2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bod1Q5SQY2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bod1Q5SQY2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bod1Q5SQY2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bod1Q5SQY2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bod1Q5SQY2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bod1Q5SQY2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bod1Q5SQY2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bod1Q5SQY2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bod1Q5SQY2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bod1Q5SQY2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bod1Q5SQY2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bod1Q5SQY2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bod1Q5SQY2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bod1Q5SQY2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bod1Q5SQY2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bod1Q5SQY2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bod1Q5SQY2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bod1Q5SQY2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bod1Q5SQY2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bod1Q5SQY2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bod1Q5SQY2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bod1Q5SQY2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bod1Q5SQY2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bod1Q5SQY2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bod1Q5SQY2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bod1Q5SQY2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bod1Q5SQY2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bod1Q5SQY2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bod1Q5SQY2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bod1Q5SQY2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bod1Q5SQY2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms