Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bhlha9Q5RJB0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bhlha9Q5RJB0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bhlha9Q5RJB0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bhlha9Q5RJB0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bhlha9Q5RJB0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlha9Q5RJB0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlha9Q5RJB0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bhlha9Q5RJB0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bhlha9Q5RJB0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bhlha9Q5RJB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bhlha9Q5RJB0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bhlha9Q5RJB0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bhlha9Q5RJB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bhlha9Q5RJB0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bhlha9Q5RJB0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bhlha9Q5RJB0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bhlha9Q5RJB0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bhlha9Q5RJB0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bhlha9Q5RJB0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bhlha9Q5RJB0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bhlha9Q5RJB0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bhlha9Q5RJB0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bhlha9Q5RJB0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bhlha9Q5RJB0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bhlha9Q5RJB0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bhlha9Q5RJB0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bhlha9Q5RJB0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bhlha9Q5RJB0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bhlha9Q5RJB0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bhlha9Q5RJB0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bhlha9Q5RJB0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bhlha9Q5RJB0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
Bhlha9Q5RJB0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlha9Q5RJB0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlha9Q5RJB0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms