Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
AY761185Q5ERI8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
AY761185Q5ERI8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
AY761185Q5ERI8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
AY761185Q5ERI8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
AY761185Q5ERI8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
AY761185Q5ERI8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
AY761185Q5ERI8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
AY761185Q5ERI8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
AY761185Q5ERI8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,21■■□□□ 1,47
AY761185Q5ERI8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
AY761185Q5ERI8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
AY761185Q5ERI8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
AY761185Q5ERI8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
AY761185Q5ERI8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
AY761185Q5ERI8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
AY761185Q5ERI8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,11■■□□□ 1,45
AY761185Q5ERI8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
AY761185Q5ERI8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
AY761185Q5ERI8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,09■■□□□ 1,45
AY761185Q5ERI8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
AY761185Q5ERI8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24,06■■□□□ 1,44
AY761185Q5ERI8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
AY761185Q5ERI8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
AY761185Q5ERI8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
AY761185Q5ERI8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
AY761185Q5ERI8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
AY761185Q5ERI8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
AY761185Q5ERI8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
AY761185Q5ERI8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
AY761185Q5ERI8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
AY761185Q5ERI8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,99■■□□□ 1,43
AY761185Q5ERI8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
AY761185Q5ERI8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
AY761185Q5ERI8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23,94■■□□□ 1,42
AY761185Q5ERI8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,91■■□□□ 1,42
AY761185Q5ERI8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
AY761185Q5ERI8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
AY761185Q5ERI8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,89■■□□□ 1,41
AY761185Q5ERI8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
AY761185Q5ERI8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,88■■□□□ 1,41
AY761185Q5ERI8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
AY761185Q5ERI8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23,87■■□□□ 1,41
AY761185Q5ERI8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
AY761185Q5ERI8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
AY761185Q5ERI8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
AY761185Q5ERI8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
AY761185Q5ERI8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
AY761185Q5ERI8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
AY761185Q5ERI8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,74■■□□□ 1,39
AY761185Q5ERI8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
AY761185Q5ERI8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
AY761185Q5ERI8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
AY761185Q5ERI8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
AY761185Q5ERI8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
AY761185Q5ERI8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
AY761185Q5ERI8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
AY761185Q5ERI8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
AY761185Q5ERI8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
AY761185Q5ERI8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
AY761185Q5ERI8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
AY761185Q5ERI8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
AY761185Q5ERI8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
AY761185Q5ERI8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
AY761185Q5ERI8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
AY761185Q5ERI8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
AY761185Q5ERI8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
AY761185Q5ERI8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,53■■□□□ 1,36
AY761185Q5ERI8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
AY761185Q5ERI8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
AY761185Q5ERI8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
AY761185Q5ERI8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
AY761185Q5ERI8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
AY761185Q5ERI8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
AY761185Q5ERI8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
AY761185Q5ERI8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
AY761185Q5ERI8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
AY761185Q5ERI8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
AY761185Q5ERI8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
AY761185Q5ERI8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
AY761185Q5ERI8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,42■■□□□ 1,34
AY761185Q5ERI8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
AY761185Q5ERI8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
AY761185Q5ERI8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
AY761185Q5ERI8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
AY761185Q5ERI8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
AY761185Q5ERI8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
AY761185Q5ERI8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
AY761185Q5ERI8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
AY761185Q5ERI8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
AY761185Q5ERI8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms