Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AY761185Q5ERI8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AY761185Q5ERI8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AY761185Q5ERI8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AY761185Q5ERI8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AY761185Q5ERI8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AY761185Q5ERI8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AY761185Q5ERI8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AY761185Q5ERI8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AY761185Q5ERI8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AY761185Q5ERI8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AY761185Q5ERI8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AY761185Q5ERI8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AY761185Q5ERI8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AY761185Q5ERI8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AY761185Q5ERI8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AY761185Q5ERI8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AY761185Q5ERI8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AY761185Q5ERI8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AY761185Q5ERI8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AY761185Q5ERI8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AY761185Q5ERI8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AY761185Q5ERI8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AY761185Q5ERI8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AY761185Q5ERI8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AY761185Q5ERI8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AY761185Q5ERI8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AY761185Q5ERI8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AY761185Q5ERI8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AY761185Q5ERI8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AY761185Q5ERI8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AY761185Q5ERI8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AY761185Q5ERI8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AY761185Q5ERI8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AY761185Q5ERI8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AY761185Q5ERI8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AY761185Q5ERI8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AY761185Q5ERI8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AY761185Q5ERI8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AY761185Q5ERI8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AY761185Q5ERI8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AY761185Q5ERI8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AY761185Q5ERI8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AY761185Q5ERI8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AY761185Q5ERI8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AY761185Q5ERI8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AY761185Q5ERI8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AY761185Q5ERI8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AY761185Q5ERI8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AY761185Q5ERI8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AY761185Q5ERI8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AY761185Q5ERI8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AY761185Q5ERI8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AY761185Q5ERI8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AY761185Q5ERI8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AY761185Q5ERI8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AY761185Q5ERI8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AY761185Q5ERI8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AY761185Q5ERI8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AY761185Q5ERI8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AY761185Q5ERI8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AY761185Q5ERI8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AY761185Q5ERI8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AY761185Q5ERI8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AY761185Q5ERI8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AY761185Q5ERI8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AY761185Q5ERI8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AY761185Q5ERI8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AY761185Q5ERI8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AY761185Q5ERI8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AY761185Q5ERI8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AY761185Q5ERI8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AY761185Q5ERI8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AY761185Q5ERI8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AY761185Q5ERI8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AY761185Q5ERI8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AY761185Q5ERI8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AY761185Q5ERI8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AY761185Q5ERI8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AY761185Q5ERI8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AY761185Q5ERI8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AY761185Q5ERI8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AY761185Q5ERI8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AY761185Q5ERI8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AY761185Q5ERI8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AY761185Q5ERI8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AY761185Q5ERI8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AY761185Q5ERI8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AY761185Q5ERI8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AY761185Q5ERI8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AY761185Q5ERI8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms