Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL25

Lhfpl5, LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl5Q4KL25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhfpl5Q4KL25 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhfpl5Q4KL25 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhfpl5Q4KL25 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhfpl5Q4KL25 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhfpl5Q4KL25 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhfpl5Q4KL25 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhfpl5Q4KL25 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhfpl5Q4KL25 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhfpl5Q4KL25 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhfpl5Q4KL25 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhfpl5Q4KL25 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhfpl5Q4KL25 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhfpl5Q4KL25 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhfpl5Q4KL25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhfpl5Q4KL25 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhfpl5Q4KL25 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhfpl5Q4KL25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhfpl5Q4KL25 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhfpl5Q4KL25 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lhfpl5Q4KL25 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhfpl5Q4KL25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhfpl5Q4KL25 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhfpl5Q4KL25 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhfpl5Q4KL25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhfpl5Q4KL25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhfpl5Q4KL25 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhfpl5Q4KL25 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhfpl5Q4KL25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhfpl5Q4KL25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms