Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930518I15RikQ3V2W7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930518I15RikQ3V2W7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930518I15RikQ3V2W7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930518I15RikQ3V2W7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930518I15RikQ3V2W7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930518I15RikQ3V2W7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930518I15RikQ3V2W7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930518I15RikQ3V2W7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930518I15RikQ3V2W7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930518I15RikQ3V2W7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930518I15RikQ3V2W7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930518I15RikQ3V2W7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930518I15RikQ3V2W7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms