Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prdm6Q3UZD5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm6Q3UZD5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm6Q3UZD5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm6Q3UZD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm6Q3UZD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm6Q3UZD5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm6Q3UZD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm6Q3UZD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm6Q3UZD5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm6Q3UZD5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm6Q3UZD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm6Q3UZD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm6Q3UZD5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm6Q3UZD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm6Q3UZD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm6Q3UZD5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm6Q3UZD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm6Q3UZD5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm6Q3UZD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm6Q3UZD5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm6Q3UZD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm6Q3UZD5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm6Q3UZD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm6Q3UZD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm6Q3UZD5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm6Q3UZD5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm6Q3UZD5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm6Q3UZD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm6Q3UZD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm6Q3UZD5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm6Q3UZD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm6Q3UZD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm6Q3UZD5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm6Q3UZD5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm6Q3UZD5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm6Q3UZD5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm6Q3UZD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm6Q3UZD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm6Q3UZD5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm6Q3UZD5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm6Q3UZD5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm6Q3UZD5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm6Q3UZD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm6Q3UZD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm6Q3UZD5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm6Q3UZD5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm6Q3UZD5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm6Q3UZD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm6Q3UZD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm6Q3UZD5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm6Q3UZD5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm6Q3UZD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm6Q3UZD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm6Q3UZD5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm6Q3UZD5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm6Q3UZD5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm6Q3UZD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prdm6Q3UZD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm6Q3UZD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm6Q3UZD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm6Q3UZD5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm6Q3UZD5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm6Q3UZD5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm6Q3UZD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm6Q3UZD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm6Q3UZD5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm6Q3UZD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm6Q3UZD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm6Q3UZD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm6Q3UZD5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm6Q3UZD5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm6Q3UZD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm6Q3UZD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm6Q3UZD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm6Q3UZD5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm6Q3UZD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm6Q3UZD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm6Q3UZD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm6Q3UZD5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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