Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2fbQ3UWQ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2fbQ3UWQ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2fbQ3UWQ3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2fbQ3UWQ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2fbQ3UWQ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube2fbQ3UWQ3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube2fbQ3UWQ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2fbQ3UWQ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2fbQ3UWQ3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2fbQ3UWQ3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2fbQ3UWQ3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2fbQ3UWQ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2fbQ3UWQ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2fbQ3UWQ3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube2fbQ3UWQ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2fbQ3UWQ3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2fbQ3UWQ3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube2fbQ3UWQ3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube2fbQ3UWQ3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2fbQ3UWQ3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2fbQ3UWQ3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2fbQ3UWQ3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2fbQ3UWQ3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2fbQ3UWQ3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube2fbQ3UWQ3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube2fbQ3UWQ3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2fbQ3UWQ3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2fbQ3UWQ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2fbQ3UWQ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2fbQ3UWQ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2fbQ3UWQ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2fbQ3UWQ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2fbQ3UWQ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2fbQ3UWQ3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2fbQ3UWQ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ube2fbQ3UWQ3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube2fbQ3UWQ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2fbQ3UWQ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2fbQ3UWQ3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2fbQ3UWQ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2fbQ3UWQ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ube2fbQ3UWQ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube2fbQ3UWQ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ube2fbQ3UWQ3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube2fbQ3UWQ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube2fbQ3UWQ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube2fbQ3UWQ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2fbQ3UWQ3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms