Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Chpf2Q3UU43 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chpf2Q3UU43 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chpf2Q3UU43 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chpf2Q3UU43 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Chpf2Q3UU43 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Chpf2Q3UU43 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chpf2Q3UU43 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chpf2Q3UU43 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chpf2Q3UU43 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chpf2Q3UU43 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chpf2Q3UU43 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chpf2Q3UU43 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chpf2Q3UU43 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chpf2Q3UU43 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chpf2Q3UU43 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Chpf2Q3UU43 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Chpf2Q3UU43 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Chpf2Q3UU43 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chpf2Q3UU43 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chpf2Q3UU43 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chpf2Q3UU43 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chpf2Q3UU43 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Chpf2Q3UU43 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Chpf2Q3UU43 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Chpf2Q3UU43 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Chpf2Q3UU43 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Chpf2Q3UU43 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chpf2Q3UU43 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chpf2Q3UU43 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chpf2Q3UU43 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chpf2Q3UU43 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chpf2Q3UU43 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Chpf2Q3UU43 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Chpf2Q3UU43 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Chpf2Q3UU43 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chpf2Q3UU43 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chpf2Q3UU43 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chpf2Q3UU43 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chpf2Q3UU43 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chpf2Q3UU43 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chpf2Q3UU43 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Chpf2Q3UU43 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Chpf2Q3UU43 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Chpf2Q3UU43 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Chpf2Q3UU43 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Chpf2Q3UU43 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Chpf2Q3UU43 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Chpf2Q3UU43 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Chpf2Q3UU43 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chpf2Q3UU43 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Chpf2Q3UU43 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Chpf2Q3UU43 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Chpf2Q3UU43 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Chpf2Q3UU43 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Chpf2Q3UU43 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chpf2Q3UU43 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Chpf2Q3UU43 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Chpf2Q3UU43 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Chpf2Q3UU43 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Chpf2Q3UU43 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Chpf2Q3UU43 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Chpf2Q3UU43 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Chpf2Q3UU43 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Chpf2Q3UU43 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Chpf2Q3UU43 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Chpf2Q3UU43 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Chpf2Q3UU43 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chpf2Q3UU43 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Chpf2Q3UU43 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Chpf2Q3UU43 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Chpf2Q3UU43 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Chpf2Q3UU43 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Chpf2Q3UU43 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Chpf2Q3UU43 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Chpf2Q3UU43 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Chpf2Q3UU43 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Chpf2Q3UU43 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Chpf2Q3UU43 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Chpf2Q3UU43 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Chpf2Q3UU43 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms