Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rbm20Q3UQS8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm20Q3UQS8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rbm20Q3UQS8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbm20Q3UQS8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rbm20Q3UQS8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rbm20Q3UQS8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rbm20Q3UQS8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm20Q3UQS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbm20Q3UQS8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rbm20Q3UQS8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm20Q3UQS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbm20Q3UQS8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbm20Q3UQS8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbm20Q3UQS8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm20Q3UQS8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm20Q3UQS8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbm20Q3UQS8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm20Q3UQS8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm20Q3UQS8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbm20Q3UQS8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbm20Q3UQS8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbm20Q3UQS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbm20Q3UQS8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rbm20Q3UQS8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbm20Q3UQS8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbm20Q3UQS8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbm20Q3UQS8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbm20Q3UQS8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbm20Q3UQS8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbm20Q3UQS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rbm20Q3UQS8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rbm20Q3UQS8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rbm20Q3UQS8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbm20Q3UQS8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbm20Q3UQS8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbm20Q3UQS8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbm20Q3UQS8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbm20Q3UQS8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbm20Q3UQS8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbm20Q3UQS8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbm20Q3UQS8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rbm20Q3UQS8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rbm20Q3UQS8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rbm20Q3UQS8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm20Q3UQS8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rbm20Q3UQS8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rbm20Q3UQS8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm20Q3UQS8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm20Q3UQS8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbm20Q3UQS8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbm20Q3UQS8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbm20Q3UQS8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm20Q3UQS8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm20Q3UQS8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm20Q3UQS8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rbm20Q3UQS8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbm20Q3UQS8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbm20Q3UQS8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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