Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Skap2Q3UND0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Skap2Q3UND0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Skap2Q3UND0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Skap2Q3UND0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Skap2Q3UND0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Skap2Q3UND0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Skap2Q3UND0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Skap2Q3UND0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Skap2Q3UND0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Skap2Q3UND0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Skap2Q3UND0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Skap2Q3UND0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Skap2Q3UND0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Skap2Q3UND0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Skap2Q3UND0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Skap2Q3UND0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Skap2Q3UND0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Skap2Q3UND0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Skap2Q3UND0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Skap2Q3UND0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Skap2Q3UND0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Skap2Q3UND0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Skap2Q3UND0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Skap2Q3UND0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Skap2Q3UND0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Skap2Q3UND0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Skap2Q3UND0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Skap2Q3UND0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Skap2Q3UND0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Skap2Q3UND0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Skap2Q3UND0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Skap2Q3UND0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Skap2Q3UND0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Skap2Q3UND0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Skap2Q3UND0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Skap2Q3UND0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Skap2Q3UND0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Skap2Q3UND0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Skap2Q3UND0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Skap2Q3UND0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Skap2Q3UND0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Skap2Q3UND0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Skap2Q3UND0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Skap2Q3UND0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Skap2Q3UND0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Skap2Q3UND0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Skap2Q3UND0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,7 ms