Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5Q7

Cmpk2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk2Q3U5Q7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmpk2Q3U5Q7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmpk2Q3U5Q7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmpk2Q3U5Q7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmpk2Q3U5Q7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmpk2Q3U5Q7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmpk2Q3U5Q7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmpk2Q3U5Q7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmpk2Q3U5Q7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cmpk2Q3U5Q7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cmpk2Q3U5Q7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cmpk2Q3U5Q7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmpk2Q3U5Q7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmpk2Q3U5Q7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cmpk2Q3U5Q7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cmpk2Q3U5Q7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmpk2Q3U5Q7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cmpk2Q3U5Q7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cmpk2Q3U5Q7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmpk2Q3U5Q7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmpk2Q3U5Q7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmpk2Q3U5Q7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmpk2Q3U5Q7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmpk2Q3U5Q7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cmpk2Q3U5Q7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cmpk2Q3U5Q7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cmpk2Q3U5Q7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cmpk2Q3U5Q7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmpk2Q3U5Q7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmpk2Q3U5Q7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmpk2Q3U5Q7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmpk2Q3U5Q7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmpk2Q3U5Q7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmpk2Q3U5Q7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmpk2Q3U5Q7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmpk2Q3U5Q7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmpk2Q3U5Q7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmpk2Q3U5Q7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmpk2Q3U5Q7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmpk2Q3U5Q7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmpk2Q3U5Q7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmpk2Q3U5Q7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmpk2Q3U5Q7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmpk2Q3U5Q7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmpk2Q3U5Q7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmpk2Q3U5Q7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms