Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
InipQ3TXT3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
InipQ3TXT3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
InipQ3TXT3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
InipQ3TXT3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
InipQ3TXT3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
InipQ3TXT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
InipQ3TXT3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
InipQ3TXT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
InipQ3TXT3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
InipQ3TXT3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
InipQ3TXT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
InipQ3TXT3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
InipQ3TXT3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
InipQ3TXT3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
InipQ3TXT3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
InipQ3TXT3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
InipQ3TXT3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
InipQ3TXT3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
InipQ3TXT3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
InipQ3TXT3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
InipQ3TXT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
InipQ3TXT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
InipQ3TXT3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
InipQ3TXT3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
InipQ3TXT3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
InipQ3TXT3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
InipQ3TXT3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
InipQ3TXT3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
InipQ3TXT3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
InipQ3TXT3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
InipQ3TXT3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
InipQ3TXT3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
InipQ3TXT3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
InipQ3TXT3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
InipQ3TXT3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
InipQ3TXT3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
InipQ3TXT3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
InipQ3TXT3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
InipQ3TXT3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
InipQ3TXT3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
InipQ3TXT3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
InipQ3TXT3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms