Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ccdc102aQ3TMW1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ccdc102aQ3TMW1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ccdc102aQ3TMW1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ccdc102aQ3TMW1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ccdc102aQ3TMW1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Ccdc102aQ3TMW1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ccdc102aQ3TMW1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc102aQ3TMW1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc102aQ3TMW1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ccdc102aQ3TMW1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ccdc102aQ3TMW1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ccdc102aQ3TMW1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ccdc102aQ3TMW1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ccdc102aQ3TMW1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Ccdc102aQ3TMW1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccdc102aQ3TMW1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc102aQ3TMW1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ccdc102aQ3TMW1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ccdc102aQ3TMW1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc102aQ3TMW1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc102aQ3TMW1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ccdc102aQ3TMW1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ccdc102aQ3TMW1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ccdc102aQ3TMW1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ccdc102aQ3TMW1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ccdc102aQ3TMW1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ccdc102aQ3TMW1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ccdc102aQ3TMW1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ccdc102aQ3TMW1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ccdc102aQ3TMW1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ccdc102aQ3TMW1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc102aQ3TMW1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc102aQ3TMW1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc102aQ3TMW1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc102aQ3TMW1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,39■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ccdc102aQ3TMW1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ccdc102aQ3TMW1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc102aQ3TMW1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc102aQ3TMW1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc102aQ3TMW1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ccdc102aQ3TMW1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc102aQ3TMW1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms