Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim71Q1PSW8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim71Q1PSW8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim71Q1PSW8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim71Q1PSW8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim71Q1PSW8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim71Q1PSW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim71Q1PSW8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim71Q1PSW8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim71Q1PSW8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim71Q1PSW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim71Q1PSW8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim71Q1PSW8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim71Q1PSW8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim71Q1PSW8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim71Q1PSW8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim71Q1PSW8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim71Q1PSW8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim71Q1PSW8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim71Q1PSW8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim71Q1PSW8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim71Q1PSW8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim71Q1PSW8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim71Q1PSW8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim71Q1PSW8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim71Q1PSW8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim71Q1PSW8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim71Q1PSW8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim71Q1PSW8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim71Q1PSW8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim71Q1PSW8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim71Q1PSW8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim71Q1PSW8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim71Q1PSW8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim71Q1PSW8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim71Q1PSW8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim71Q1PSW8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim71Q1PSW8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim71Q1PSW8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim71Q1PSW8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim71Q1PSW8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim71Q1PSW8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim71Q1PSW8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim71Q1PSW8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim71Q1PSW8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim71Q1PSW8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim71Q1PSW8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim71Q1PSW8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim71Q1PSW8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim71Q1PSW8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim71Q1PSW8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim71Q1PSW8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim71Q1PSW8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim71Q1PSW8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim71Q1PSW8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim71Q1PSW8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim71Q1PSW8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim71Q1PSW8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim71Q1PSW8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim71Q1PSW8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim71Q1PSW8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim71Q1PSW8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim71Q1PSW8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim71Q1PSW8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim71Q1PSW8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim71Q1PSW8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim71Q1PSW8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim71Q1PSW8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim71Q1PSW8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim71Q1PSW8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim71Q1PSW8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim71Q1PSW8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim71Q1PSW8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim71Q1PSW8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim71Q1PSW8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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