Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp8b1Q148W0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp8b1Q148W0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp8b1Q148W0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b1Q148W0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b1Q148W0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp8b1Q148W0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp8b1Q148W0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp8b1Q148W0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp8b1Q148W0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp8b1Q148W0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp8b1Q148W0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp8b1Q148W0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp8b1Q148W0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8b1Q148W0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp8b1Q148W0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8b1Q148W0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp8b1Q148W0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8b1Q148W0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp8b1Q148W0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp8b1Q148W0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp8b1Q148W0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp8b1Q148W0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8b1Q148W0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b1Q148W0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp8b1Q148W0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b1Q148W0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8b1Q148W0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8b1Q148W0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b1Q148W0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8b1Q148W0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b1Q148W0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8b1Q148W0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp8b1Q148W0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp8b1Q148W0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp8b1Q148W0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8b1Q148W0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8b1Q148W0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp8b1Q148W0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp8b1Q148W0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp8b1Q148W0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b1Q148W0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b1Q148W0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b1Q148W0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b1Q148W0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp8b1Q148W0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b1Q148W0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp8b1Q148W0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b1Q148W0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b1Q148W0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b1Q148W0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b1Q148W0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp8b1Q148W0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b1Q148W0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
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