Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc162pQ0VG85 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc162pQ0VG85 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc162pQ0VG85 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc162pQ0VG85 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc162pQ0VG85 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc162pQ0VG85 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc162pQ0VG85 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc162pQ0VG85 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc162pQ0VG85 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc162pQ0VG85 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc162pQ0VG85 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc162pQ0VG85 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc162pQ0VG85 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc162pQ0VG85 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc162pQ0VG85 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc162pQ0VG85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc162pQ0VG85 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc162pQ0VG85 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc162pQ0VG85 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc162pQ0VG85 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc162pQ0VG85 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc162pQ0VG85 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc162pQ0VG85 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc162pQ0VG85 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc162pQ0VG85 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc162pQ0VG85 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc162pQ0VG85 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc162pQ0VG85 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc162pQ0VG85 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc162pQ0VG85 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc162pQ0VG85 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc162pQ0VG85 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc162pQ0VG85 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc162pQ0VG85 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc162pQ0VG85 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc162pQ0VG85 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc162pQ0VG85 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc162pQ0VG85 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc162pQ0VG85 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms