Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Calb2Q08331 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Calb2Q08331 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Calb2Q08331 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Calb2Q08331 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Calb2Q08331 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Calb2Q08331 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Calb2Q08331 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Calb2Q08331 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Calb2Q08331 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Calb2Q08331 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Calb2Q08331 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Calb2Q08331 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Calb2Q08331 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Calb2Q08331 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Calb2Q08331 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Calb2Q08331 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Calb2Q08331 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Calb2Q08331 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Calb2Q08331 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Calb2Q08331 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Calb2Q08331 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Calb2Q08331 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Calb2Q08331 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Calb2Q08331 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Calb2Q08331 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Calb2Q08331 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Calb2Q08331 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Calb2Q08331 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Calb2Q08331 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Calb2Q08331 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Calb2Q08331 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Calb2Q08331 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Calb2Q08331 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Calb2Q08331 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Calb2Q08331 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Calb2Q08331 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Calb2Q08331 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Calb2Q08331 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Calb2Q08331 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Calb2Q08331 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Calb2Q08331 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Calb2Q08331 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Calb2Q08331 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Calb2Q08331 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Calb2Q08331 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Calb2Q08331 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,3 ms