Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cntn3Q07409 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cntn3Q07409 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cntn3Q07409 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cntn3Q07409 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cntn3Q07409 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cntn3Q07409 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cntn3Q07409 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cntn3Q07409 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cntn3Q07409 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cntn3Q07409 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cntn3Q07409 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cntn3Q07409 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cntn3Q07409 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cntn3Q07409 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cntn3Q07409 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cntn3Q07409 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cntn3Q07409 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cntn3Q07409 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cntn3Q07409 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cntn3Q07409 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cntn3Q07409 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cntn3Q07409 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cntn3Q07409 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cntn3Q07409 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cntn3Q07409 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cntn3Q07409 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cntn3Q07409 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cntn3Q07409 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cntn3Q07409 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cntn3Q07409 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cntn3Q07409 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cntn3Q07409 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cntn3Q07409 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cntn3Q07409 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cntn3Q07409 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cntn3Q07409 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cntn3Q07409 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cntn3Q07409 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cntn3Q07409 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cntn3Q07409 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cntn3Q07409 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cntn3Q07409 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntn3Q07409 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntn3Q07409 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cntn3Q07409 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cntn3Q07409 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cntn3Q07409 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cntn3Q07409 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cntn3Q07409 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cntn3Q07409 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntn3Q07409 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntn3Q07409 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntn3Q07409 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntn3Q07409 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cntn3Q07409 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cntn3Q07409 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntn3Q07409 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntn3Q07409 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntn3Q07409 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntn3Q07409 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntn3Q07409 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cntn3Q07409 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntn3Q07409 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cntn3Q07409 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms