Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Col9a1Q05722 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Col9a1Q05722 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col9a1Q05722 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col9a1Q05722 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col9a1Q05722 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col9a1Q05722 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col9a1Q05722 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col9a1Q05722 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col9a1Q05722 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col9a1Q05722 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col9a1Q05722 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col9a1Q05722 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col9a1Q05722 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col9a1Q05722 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col9a1Q05722 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col9a1Q05722 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col9a1Q05722 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col9a1Q05722 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col9a1Q05722 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col9a1Q05722 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col9a1Q05722 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col9a1Q05722 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Col9a1Q05722 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col9a1Q05722 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col9a1Q05722 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col9a1Q05722 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col9a1Q05722 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col9a1Q05722 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Col9a1Q05722 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col9a1Q05722 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col9a1Q05722 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col9a1Q05722 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col9a1Q05722 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col9a1Q05722 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col9a1Q05722 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col9a1Q05722 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col9a1Q05722 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col9a1Q05722 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col9a1Q05722 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col9a1Q05722 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col9a1Q05722 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col9a1Q05722 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col9a1Q05722 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col9a1Q05722 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col9a1Q05722 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col9a1Q05722 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col9a1Q05722 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col9a1Q05722 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col9a1Q05722 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col9a1Q05722 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Col9a1Q05722 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Col9a1Q05722 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col9a1Q05722 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col9a1Q05722 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Col9a1Q05722 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col9a1Q05722 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col9a1Q05722 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col9a1Q05722 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col9a1Q05722 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col9a1Q05722 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col9a1Q05722 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col9a1Q05722 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col9a1Q05722 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col9a1Q05722 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col9a1Q05722 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col9a1Q05722 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col9a1Q05722 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col9a1Q05722 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Col9a1Q05722 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col9a1Q05722 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col9a1Q05722 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col9a1Q05722 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col9a1Q05722 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col9a1Q05722 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Col9a1Q05722 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col9a1Q05722 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col9a1Q05722 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col9a1Q05722 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Col9a1Q05722 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col9a1Q05722 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col9a1Q05722 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col9a1Q05722 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col9a1Q05722 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Col9a1Q05722 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col9a1Q05722 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col9a1Q05722 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col9a1Q05722 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col9a1Q05722 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col9a1Q05722 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col9a1Q05722 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col9a1Q05722 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms