Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rcn1Q05186 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rcn1Q05186 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rcn1Q05186 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rcn1Q05186 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rcn1Q05186 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rcn1Q05186 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rcn1Q05186 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Rcn1Q05186 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rcn1Q05186 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rcn1Q05186 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rcn1Q05186 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rcn1Q05186 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Rcn1Q05186 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Rcn1Q05186 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rcn1Q05186 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rcn1Q05186 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rcn1Q05186 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rcn1Q05186 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rcn1Q05186 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rcn1Q05186 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rcn1Q05186 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rcn1Q05186 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rcn1Q05186 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rcn1Q05186 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rcn1Q05186 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rcn1Q05186 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rcn1Q05186 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rcn1Q05186 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rcn1Q05186 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rcn1Q05186 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rcn1Q05186 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rcn1Q05186 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rcn1Q05186 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rcn1Q05186 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rcn1Q05186 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rcn1Q05186 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rcn1Q05186 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rcn1Q05186 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rcn1Q05186 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rcn1Q05186 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rcn1Q05186 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Rcn1Q05186 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rcn1Q05186 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rcn1Q05186 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rcn1Q05186 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rcn1Q05186 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rcn1Q05186 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rcn1Q05186 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rcn1Q05186 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rcn1Q05186 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Rcn1Q05186 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rcn1Q05186 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Rcn1Q05186 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rcn1Q05186 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Rcn1Q05186 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rcn1Q05186 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rcn1Q05186 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Rcn1Q05186 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Rcn1Q05186 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rcn1Q05186 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rcn1Q05186 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,6 ms