Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rcn1Q05186 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rcn1Q05186 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rcn1Q05186 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rcn1Q05186 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rcn1Q05186 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rcn1Q05186 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rcn1Q05186 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rcn1Q05186 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rcn1Q05186 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rcn1Q05186 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rcn1Q05186 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rcn1Q05186 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rcn1Q05186 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rcn1Q05186 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rcn1Q05186 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rcn1Q05186 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rcn1Q05186 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rcn1Q05186 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rcn1Q05186 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rcn1Q05186 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rcn1Q05186 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rcn1Q05186 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rcn1Q05186 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rcn1Q05186 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rcn1Q05186 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rcn1Q05186 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rcn1Q05186 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rcn1Q05186 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rcn1Q05186 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rcn1Q05186 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rcn1Q05186 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcn1Q05186 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcn1Q05186 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rcn1Q05186 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rcn1Q05186 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rcn1Q05186 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rcn1Q05186 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rcn1Q05186 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rcn1Q05186 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rcn1Q05186 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rcn1Q05186 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rcn1Q05186 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rcn1Q05186 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rcn1Q05186 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcn1Q05186 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcn1Q05186 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rcn1Q05186 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rcn1Q05186 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rcn1Q05186 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rcn1Q05186 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rcn1Q05186 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rcn1Q05186 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rcn1Q05186 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rcn1Q05186 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rcn1Q05186 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rcn1Q05186 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rcn1Q05186 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rcn1Q05186 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rcn1Q05186 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rcn1Q05186 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rcn1Q05186 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms