Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sox10Q04888 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sox10Q04888 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sox10Q04888 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sox10Q04888 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sox10Q04888 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Sox10Q04888 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sox10Q04888 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sox10Q04888 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sox10Q04888 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sox10Q04888 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sox10Q04888 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox10Q04888 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox10Q04888 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sox10Q04888 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sox10Q04888 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox10Q04888 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox10Q04888 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Sox10Q04888 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sox10Q04888 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sox10Q04888 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sox10Q04888 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sox10Q04888 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sox10Q04888 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sox10Q04888 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sox10Q04888 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sox10Q04888 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sox10Q04888 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sox10Q04888 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sox10Q04888 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Sox10Q04888 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox10Q04888 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox10Q04888 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sox10Q04888 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sox10Q04888 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sox10Q04888 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sox10Q04888 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox10Q04888 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox10Q04888 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sox10Q04888 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sox10Q04888 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sox10Q04888 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sox10Q04888 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sox10Q04888 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Sox10Q04888 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sox10Q04888 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Sox10Q04888 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sox10Q04888 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sox10Q04888 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sox10Q04888 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sox10Q04888 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sox10Q04888 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sox10Q04888 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sox10Q04888 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sox10Q04888 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sox10Q04888 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sox10Q04888 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Sox10Q04888 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sox10Q04888 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sox10Q04888 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox10Q04888 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox10Q04888 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox10Q04888 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sox10Q04888 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sox10Q04888 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sox10Q04888 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sox10Q04888 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sox10Q04888 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sox10Q04888 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox10Q04888 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sox10Q04888 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sox10Q04888 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sox10Q04888 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sox10Q04888 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sox10Q04888 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sox10Q04888 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sox10Q04888 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sox10Q04888 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sox10Q04888 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sox10Q04888 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sox10Q04888 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms