Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsu1Q01730 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsu1Q01730 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsu1Q01730 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsu1Q01730 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsu1Q01730 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsu1Q01730 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsu1Q01730 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsu1Q01730 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsu1Q01730 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsu1Q01730 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsu1Q01730 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsu1Q01730 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsu1Q01730 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsu1Q01730 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rsu1Q01730 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsu1Q01730 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsu1Q01730 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsu1Q01730 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsu1Q01730 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsu1Q01730 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsu1Q01730 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsu1Q01730 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsu1Q01730 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsu1Q01730 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsu1Q01730 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsu1Q01730 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsu1Q01730 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsu1Q01730 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsu1Q01730 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsu1Q01730 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsu1Q01730 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsu1Q01730 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsu1Q01730 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsu1Q01730 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsu1Q01730 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsu1Q01730 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsu1Q01730 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsu1Q01730 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsu1Q01730 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsu1Q01730 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsu1Q01730 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms