Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn1bP97952 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn1bP97952 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn1bP97952 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn1bP97952 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn1bP97952 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn1bP97952 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn1bP97952 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1bP97952 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1bP97952 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1bP97952 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1bP97952 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1bP97952 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1bP97952 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1bP97952 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn1bP97952 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn1bP97952 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1bP97952 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn1bP97952 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1bP97952 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1bP97952 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn1bP97952 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn1bP97952 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn1bP97952 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn1bP97952 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn1bP97952 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn1bP97952 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn1bP97952 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn1bP97952 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn1bP97952 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn1bP97952 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1bP97952 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1bP97952 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1bP97952 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn1bP97952 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn1bP97952 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1bP97952 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn1bP97952 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn1bP97952 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn1bP97952 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn1bP97952 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn1bP97952 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn1bP97952 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn1bP97952 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn1bP97952 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn1bP97952 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn1bP97952 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn1bP97952 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn1bP97952 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn1bP97952 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn1bP97952 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1bP97952 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn1bP97952 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1bP97952 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn1bP97952 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn1bP97952 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn1bP97952 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms