Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Nkx2-3P97334 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Nkx2-3P97334 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Nkx2-3P97334 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Nkx2-3P97334 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nkx2-3P97334 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nkx2-3P97334 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Nkx2-3P97334 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Nkx2-3P97334 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Nkx2-3P97334 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Nkx2-3P97334 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Nkx2-3P97334 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Nkx2-3P97334 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Nkx2-3P97334 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Nkx2-3P97334 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Nkx2-3P97334 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Nkx2-3P97334 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Nkx2-3P97334 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Nkx2-3P97334 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Nkx2-3P97334 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nkx2-3P97334 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Nkx2-3P97334 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Nkx2-3P97334 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Nkx2-3P97334 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Nkx2-3P97334 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Nkx2-3P97334 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Nkx2-3P97334 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Nkx2-3P97334 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Nkx2-3P97334 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Nkx2-3P97334 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Nkx2-3P97334 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Nkx2-3P97334 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,99■■■■□ 3,03
Nkx2-3P97334 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Nkx2-3P97334 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Nkx2-3P97334 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Nkx2-3P97334 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nkx2-3P97334 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Nkx2-3P97334 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Nkx2-3P97334 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Nkx2-3P97334 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Nkx2-3P97334 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Nkx2-3P97334 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Nkx2-3P97334 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Nkx2-3P97334 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Nkx2-3P97334 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Nkx2-3P97334 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,98
Nkx2-3P97334 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Nkx2-3P97334 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Nkx2-3P97334 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Nkx2-3P97334 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Nkx2-3P97334 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Nkx2-3P97334 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Nkx2-3P97334 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Nkx2-3P97334 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Nkx2-3P97334 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Nkx2-3P97334 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Nkx2-3P97334 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Nkx2-3P97334 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Nkx2-3P97334 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Nkx2-3P97334 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Nkx2-3P97334 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Nkx2-3P97334 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Nkx2-3P97334 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33,45■■■□□ 2,94
Nkx2-3P97334 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Nkx2-3P97334 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Nkx2-3P97334 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Nkx2-3P97334 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Nkx2-3P97334 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Nkx2-3P97334 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Nkx2-3P97334 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Nkx2-3P97334 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Nkx2-3P97334 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Nkx2-3P97334 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Nkx2-3P97334 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Nkx2-3P97334 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Nkx2-3P97334 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Nkx2-3P97334 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Nkx2-3P97334 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Nkx2-3P97334 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Nkx2-3P97334 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Nkx2-3P97334 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,7 ms