Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrp1P97333 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nrp1P97333 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nrp1P97333 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrp1P97333 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nrp1P97333 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrp1P97333 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrp1P97333 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nrp1P97333 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nrp1P97333 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nrp1P97333 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nrp1P97333 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nrp1P97333 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nrp1P97333 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrp1P97333 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrp1P97333 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrp1P97333 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrp1P97333 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrp1P97333 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nrp1P97333 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nrp1P97333 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nrp1P97333 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nrp1P97333 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nrp1P97333 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nrp1P97333 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nrp1P97333 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrp1P97333 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrp1P97333 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nrp1P97333 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrp1P97333 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrp1P97333 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrp1P97333 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrp1P97333 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrp1P97333 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrp1P97333 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrp1P97333 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nrp1P97333 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrp1P97333 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrp1P97333 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrp1P97333 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nrp1P97333 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nrp1P97333 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrp1P97333 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrp1P97333 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nrp1P97333 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nrp1P97333 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nrp1P97333 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrp1P97333 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrp1P97333 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nrp1P97333 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nrp1P97333 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nrp1P97333 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nrp1P97333 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nrp1P97333 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nrp1P97333 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nrp1P97333 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nrp1P97333 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nrp1P97333 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nrp1P97333 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nrp1P97333 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nrp1P97333 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nrp1P97333 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nrp1P97333 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nrp1P97333 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nrp1P97333 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms