Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cbx1P83917 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cbx1P83917 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cbx1P83917 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cbx1P83917 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cbx1P83917 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cbx1P83917 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cbx1P83917 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cbx1P83917 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cbx1P83917 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cbx1P83917 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cbx1P83917 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cbx1P83917 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cbx1P83917 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cbx1P83917 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cbx1P83917 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cbx1P83917 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cbx1P83917 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cbx1P83917 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cbx1P83917 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cbx1P83917 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cbx1P83917 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cbx1P83917 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cbx1P83917 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cbx1P83917 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cbx1P83917 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cbx1P83917 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cbx1P83917 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cbx1P83917 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cbx1P83917 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cbx1P83917 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cbx1P83917 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cbx1P83917 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cbx1P83917 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cbx1P83917 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cbx1P83917 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cbx1P83917 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cbx1P83917 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cbx1P83917 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cbx1P83917 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cbx1P83917 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cbx1P83917 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cbx1P83917 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cbx1P83917 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cbx1P83917 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cbx1P83917 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cbx1P83917 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cbx1P83917 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cbx1P83917 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cbx1P83917 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cbx1P83917 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cbx1P83917 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cbx1P83917 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cbx1P83917 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cbx1P83917 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cbx1P83917 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cbx1P83917 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cbx1P83917 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cbx1P83917 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cbx1P83917 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms