Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Irx3P81067 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Irx3P81067 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Irx3P81067 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Irx3P81067 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Irx3P81067 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Irx3P81067 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Irx3P81067 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Irx3P81067 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Irx3P81067 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Irx3P81067 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Irx3P81067 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Irx3P81067 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Irx3P81067 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Irx3P81067 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Irx3P81067 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Irx3P81067 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Irx3P81067 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Irx3P81067 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Irx3P81067 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Irx3P81067 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Irx3P81067 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Irx3P81067 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Irx3P81067 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Irx3P81067 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Irx3P81067 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Irx3P81067 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Irx3P81067 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Irx3P81067 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Irx3P81067 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Irx3P81067 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Irx3P81067 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Irx3P81067 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Irx3P81067 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Irx3P81067 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Irx3P81067 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Irx3P81067 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Irx3P81067 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Irx3P81067 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Irx3P81067 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Irx3P81067 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Irx3P81067 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Irx3P81067 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Irx3P81067 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Irx3P81067 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Irx3P81067 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Irx3P81067 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Irx3P81067 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Irx3P81067 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Irx3P81067 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Irx3P81067 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Irx3P81067 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Irx3P81067 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Irx3P81067 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Irx3P81067 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Irx3P81067 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Irx3P81067 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Irx3P81067 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Irx3P81067 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Irx3P81067 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Irx3P81067 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Irx3P81067 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Irx3P81067 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Irx3P81067 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Irx3P81067 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Irx3P81067 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Irx3P81067 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Irx3P81067 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Irx3P81067 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Irx3P81067 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Irx3P81067 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Irx3P81067 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Irx3P81067 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Irx3P81067 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Irx3P81067 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Irx3P81067 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Irx3P81067 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Irx3P81067 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Irx3P81067 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Irx3P81067 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Irx3P81067 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Irx3P81067 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Irx3P81067 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Irx3P81067 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Irx3P81067 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Irx3P81067 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Irx3P81067 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Irx3P81067 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Irx3P81067 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Irx3P81067 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms