Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxd13P70217 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxd13P70217 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxd13P70217 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxd13P70217 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxd13P70217 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxd13P70217 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd13P70217 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxd13P70217 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd13P70217 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hoxd13P70217 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxd13P70217 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxd13P70217 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxd13P70217 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxd13P70217 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxd13P70217 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxd13P70217 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd13P70217 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxd13P70217 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxd13P70217 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd13P70217 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd13P70217 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd13P70217 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd13P70217 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd13P70217 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd13P70217 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxd13P70217 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd13P70217 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd13P70217 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd13P70217 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd13P70217 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd13P70217 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxd13P70217 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd13P70217 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd13P70217 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd13P70217 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd13P70217 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxd13P70217 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxd13P70217 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd13P70217 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd13P70217 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd13P70217 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxd13P70217 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxd13P70217 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxd13P70217 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxd13P70217 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxd13P70217 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxd13P70217 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxd13P70217 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Hoxd13P70217 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxd13P70217 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxd13P70217 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxd13P70217 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxd13P70217 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxd13P70217 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxd13P70217 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxd13P70217 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms