Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crnkl1P63154 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Crnkl1P63154 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crnkl1P63154 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crnkl1P63154 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crnkl1P63154 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crnkl1P63154 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crnkl1P63154 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crnkl1P63154 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crnkl1P63154 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crnkl1P63154 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crnkl1P63154 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crnkl1P63154 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crnkl1P63154 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crnkl1P63154 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crnkl1P63154 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crnkl1P63154 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crnkl1P63154 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crnkl1P63154 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crnkl1P63154 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crnkl1P63154 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crnkl1P63154 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crnkl1P63154 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crnkl1P63154 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crnkl1P63154 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crnkl1P63154 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crnkl1P63154 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crnkl1P63154 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crnkl1P63154 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crnkl1P63154 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Crnkl1P63154 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crnkl1P63154 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crnkl1P63154 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crnkl1P63154 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crnkl1P63154 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Crnkl1P63154 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crnkl1P63154 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crnkl1P63154 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crnkl1P63154 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Crnkl1P63154 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crnkl1P63154 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crnkl1P63154 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crnkl1P63154 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crnkl1P63154 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crnkl1P63154 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crnkl1P63154 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Crnkl1P63154 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crnkl1P63154 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crnkl1P63154 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crnkl1P63154 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Crnkl1P63154 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crnkl1P63154 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crnkl1P63154 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Crnkl1P63154 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crnkl1P63154 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crnkl1P63154 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crnkl1P63154 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crnkl1P63154 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crnkl1P63154 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crnkl1P63154 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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