Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tdrd6P61407 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tdrd6P61407 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd6P61407 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd6P61407 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd6P61407 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tdrd6P61407 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tdrd6P61407 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tdrd6P61407 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tdrd6P61407 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tdrd6P61407 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd6P61407 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tdrd6P61407 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd6P61407 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd6P61407 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd6P61407 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd6P61407 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd6P61407 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd6P61407 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd6P61407 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd6P61407 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd6P61407 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd6P61407 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd6P61407 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd6P61407 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd6P61407 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd6P61407 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd6P61407 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd6P61407 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd6P61407 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd6P61407 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd6P61407 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd6P61407 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd6P61407 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd6P61407 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd6P61407 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd6P61407 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd6P61407 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd6P61407 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd6P61407 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tdrd6P61407 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tdrd6P61407 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tdrd6P61407 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tdrd6P61407 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tdrd6P61407 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tdrd6P61407 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tdrd6P61407 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tdrd6P61407 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tdrd6P61407 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tdrd6P61407 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tdrd6P61407 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd6P61407 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd6P61407 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd6P61407 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tdrd6P61407 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tdrd6P61407 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tdrd6P61407 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd6P61407 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd6P61407 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd6P61407 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd6P61407 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd6P61407 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd6P61407 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd6P61407 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd6P61407 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd6P61407 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms