Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2iP60898 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr2iP60898 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2iP60898 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2iP60898 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2iP60898 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2iP60898 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2iP60898 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2iP60898 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr2iP60898 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2iP60898 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2iP60898 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2iP60898 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2iP60898 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2iP60898 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2iP60898 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Polr2iP60898 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2iP60898 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2iP60898 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2iP60898 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2iP60898 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2iP60898 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2iP60898 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2iP60898 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2iP60898 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2iP60898 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2iP60898 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2iP60898 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2iP60898 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2iP60898 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2iP60898 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Polr2iP60898 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2iP60898 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2iP60898 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2iP60898 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2iP60898 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2iP60898 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2iP60898 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2iP60898 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2iP60898 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2iP60898 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2iP60898 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2iP60898 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms