Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sem1P60897 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sem1P60897 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sem1P60897 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sem1P60897 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sem1P60897 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sem1P60897 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sem1P60897 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sem1P60897 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sem1P60897 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sem1P60897 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sem1P60897 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sem1P60897 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sem1P60897 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sem1P60897 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sem1P60897 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sem1P60897 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sem1P60897 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sem1P60897 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sem1P60897 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sem1P60897 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sem1P60897 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sem1P60897 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sem1P60897 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sem1P60897 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sem1P60897 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sem1P60897 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sem1P60897 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sem1P60897 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sem1P60897 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sem1P60897 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sem1P60897 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sem1P60897 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sem1P60897 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sem1P60897 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sem1P60897 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sem1P60897 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sem1P60897 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sem1P60897 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sem1P60897 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sem1P60897 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sem1P60897 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sem1P60897 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sem1P60897 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sem1P60897 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sem1P60897 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sem1P60897 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sem1P60897 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms