Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Megf8P60882 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Megf8P60882 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Megf8P60882 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Megf8P60882 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Megf8P60882 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Megf8P60882 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Megf8P60882 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Megf8P60882 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Megf8P60882 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Megf8P60882 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Megf8P60882 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Megf8P60882 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Megf8P60882 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Megf8P60882 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Megf8P60882 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Megf8P60882 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Megf8P60882 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Megf8P60882 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Megf8P60882 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Megf8P60882 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Megf8P60882 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Megf8P60882 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Megf8P60882 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Megf8P60882 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Megf8P60882 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Megf8P60882 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Megf8P60882 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Megf8P60882 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Megf8P60882 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Megf8P60882 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Megf8P60882 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Megf8P60882 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Megf8P60882 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Megf8P60882 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Megf8P60882 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Megf8P60882 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Megf8P60882 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Megf8P60882 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Megf8P60882 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Megf8P60882 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Megf8P60882 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Megf8P60882 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Megf8P60882 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Megf8P60882 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Megf8P60882 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Megf8P60882 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Megf8P60882 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Megf8P60882 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Megf8P60882 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Megf8P60882 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Megf8P60882 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Megf8P60882 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Megf8P60882 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Megf8P60882 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Megf8P60882 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Megf8P60882 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Megf8P60882 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Megf8P60882 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Megf8P60882 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Megf8P60882 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Megf8P60882 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Megf8P60882 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Megf8P60882 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Megf8P60882 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Megf8P60882 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Megf8P60882 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Megf8P60882 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Megf8P60882 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Megf8P60882 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Megf8P60882 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Megf8P60882 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Megf8P60882 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Megf8P60882 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Megf8P60882 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Megf8P60882 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Megf8P60882 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Megf8P60882 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Megf8P60882 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Megf8P60882 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Megf8P60882 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Megf8P60882 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Megf8P60882 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Megf8P60882 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Megf8P60882 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Megf8P60882 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Megf8P60882 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Megf8P60882 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171 ms