Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hps5P59438 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Hps5P59438 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hps5P59438 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hps5P59438 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hps5P59438 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hps5P59438 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hps5P59438 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Hps5P59438 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hps5P59438 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hps5P59438 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hps5P59438 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hps5P59438 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hps5P59438 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hps5P59438 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hps5P59438 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hps5P59438 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hps5P59438 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hps5P59438 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hps5P59438 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hps5P59438 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hps5P59438 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Hps5P59438 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hps5P59438 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hps5P59438 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hps5P59438 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hps5P59438 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hps5P59438 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Hps5P59438 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hps5P59438 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hps5P59438 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hps5P59438 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hps5P59438 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hps5P59438 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hps5P59438 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hps5P59438 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hps5P59438 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hps5P59438 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hps5P59438 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Hps5P59438 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hps5P59438 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hps5P59438 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hps5P59438 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hps5P59438 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hps5P59438 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hps5P59438 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hps5P59438 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hps5P59438 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hps5P59438 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hps5P59438 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hps5P59438 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hps5P59438 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hps5P59438 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hps5P59438 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hps5P59438 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hps5P59438 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hps5P59438 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hps5P59438 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hps5P59438 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hps5P59438 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hps5P59438 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hps5P59438 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hps5P59438 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hps5P59438 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hps5P59438 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hps5P59438 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hps5P59438 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hps5P59438 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hps5P59438 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hps5P59438 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Hps5P59438 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hps5P59438 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hps5P59438 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Hps5P59438 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hps5P59438 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Hps5P59438 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hps5P59438 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hps5P59438 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hps5P59438 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hps5P59438 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hps5P59438 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hps5P59438 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hps5P59438 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms