Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Csrnp1P59054 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Csrnp1P59054 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Csrnp1P59054 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Csrnp1P59054 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Csrnp1P59054 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Csrnp1P59054 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Csrnp1P59054 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Csrnp1P59054 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Csrnp1P59054 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Csrnp1P59054 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Csrnp1P59054 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Csrnp1P59054 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Csrnp1P59054 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Csrnp1P59054 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Csrnp1P59054 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Csrnp1P59054 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Csrnp1P59054 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Csrnp1P59054 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Csrnp1P59054 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Csrnp1P59054 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Csrnp1P59054 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Csrnp1P59054 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Csrnp1P59054 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Csrnp1P59054 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Csrnp1P59054 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Csrnp1P59054 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Csrnp1P59054 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Csrnp1P59054 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Csrnp1P59054 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Csrnp1P59054 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Csrnp1P59054 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Csrnp1P59054 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Csrnp1P59054 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Csrnp1P59054 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Csrnp1P59054 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Csrnp1P59054 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Csrnp1P59054 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Csrnp1P59054 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Csrnp1P59054 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Csrnp1P59054 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Csrnp1P59054 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Csrnp1P59054 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Csrnp1P59054 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Csrnp1P59054 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Csrnp1P59054 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Csrnp1P59054 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Csrnp1P59054 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Csrnp1P59054 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Csrnp1P59054 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Csrnp1P59054 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Csrnp1P59054 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Csrnp1P59054 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Csrnp1P59054 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Csrnp1P59054 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Csrnp1P59054 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Csrnp1P59054 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Csrnp1P59054 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Csrnp1P59054 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Csrnp1P59054 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Csrnp1P59054 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Csrnp1P59054 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Csrnp1P59054 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Csrnp1P59054 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Csrnp1P59054 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Csrnp1P59054 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Csrnp1P59054 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Csrnp1P59054 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Csrnp1P59054 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Csrnp1P59054 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Csrnp1P59054 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Csrnp1P59054 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Csrnp1P59054 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Csrnp1P59054 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Csrnp1P59054 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Csrnp1P59054 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Csrnp1P59054 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Csrnp1P59054 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Csrnp1P59054 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Csrnp1P59054 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Csrnp1P59054 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Csrnp1P59054 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Csrnp1P59054 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Csrnp1P59054 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Csrnp1P59054 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Csrnp1P59054 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Csrnp1P59054 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Csrnp1P59054 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Csrnp1P59054 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Csrnp1P59054 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms