Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd5P56812 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd5P56812 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcd5P56812 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd5P56812 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd5P56812 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd5P56812 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd5P56812 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd5P56812 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd5P56812 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd5P56812 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd5P56812 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd5P56812 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd5P56812 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd5P56812 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd5P56812 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd5P56812 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd5P56812 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd5P56812 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd5P56812 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd5P56812 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd5P56812 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd5P56812 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd5P56812 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd5P56812 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdcd5P56812 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd5P56812 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd5P56812 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd5P56812 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd5P56812 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd5P56812 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd5P56812 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd5P56812 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd5P56812 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd5P56812 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd5P56812 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcd5P56812 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcd5P56812 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcd5P56812 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcd5P56812 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcd5P56812 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcd5P56812 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcd5P56812 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd5P56812 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd5P56812 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd5P56812 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms