Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpn5P54830 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptpn5P54830 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptpn5P54830 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpn5P54830 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpn5P54830 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpn5P54830 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn5P54830 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn5P54830 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn5P54830 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptpn5P54830 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptpn5P54830 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptpn5P54830 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptpn5P54830 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptpn5P54830 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ptpn5P54830 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpn5P54830 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptpn5P54830 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn5P54830 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn5P54830 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn5P54830 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ptpn5P54830 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ptpn5P54830 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpn5P54830 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptpn5P54830 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptpn5P54830 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpn5P54830 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpn5P54830 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptpn5P54830 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ptpn5P54830 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptpn5P54830 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptpn5P54830 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpn5P54830 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptpn5P54830 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptpn5P54830 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptpn5P54830 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn5P54830 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptpn5P54830 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpn5P54830 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpn5P54830 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpn5P54830 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpn5P54830 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptpn5P54830 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptpn5P54830 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptpn5P54830 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptpn5P54830 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpn5P54830 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptpn5P54830 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ptpn5P54830 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ptpn5P54830 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpn5P54830 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpn5P54830 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ptpn5P54830 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpn5P54830 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpn5P54830 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn5P54830 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn5P54830 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn5P54830 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpn5P54830 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptpn5P54830 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn5P54830 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpn5P54830 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn5P54830 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn5P54830 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpn5P54830 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpn5P54830 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms