Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RorcP51450 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RorcP51450 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RorcP51450 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RorcP51450 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RorcP51450 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RorcP51450 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RorcP51450 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RorcP51450 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RorcP51450 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RorcP51450 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RorcP51450 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RorcP51450 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RorcP51450 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RorcP51450 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RorcP51450 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RorcP51450 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RorcP51450 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RorcP51450 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RorcP51450 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RorcP51450 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RorcP51450 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RorcP51450 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RorcP51450 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RorcP51450 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RorcP51450 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RorcP51450 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RorcP51450 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RorcP51450 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RorcP51450 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RorcP51450 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RorcP51450 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RorcP51450 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RorcP51450 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RorcP51450 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RorcP51450 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RorcP51450 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RorcP51450 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RorcP51450 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RorcP51450 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RorcP51450 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RorcP51450 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RorcP51450 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RorcP51450 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RorcP51450 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RorcP51450 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RorcP51450 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RorcP51450 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RorcP51450 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RorcP51450 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RorcP51450 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RorcP51450 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RorcP51450 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RorcP51450 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RorcP51450 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RorcP51450 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RorcP51450 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RorcP51450 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RorcP51450 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RorcP51450 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RorcP51450 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RorcP51450 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RorcP51450 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RorcP51450 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RorcP51450 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RorcP51450 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RorcP51450 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RorcP51450 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RorcP51450 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RorcP51450 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RorcP51450 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RorcP51450 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RorcP51450 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RorcP51450 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RorcP51450 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RorcP51450 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RorcP51450 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RorcP51450 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RorcP51450 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RorcP51450 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RorcP51450 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RorcP51450 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RorcP51450 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RorcP51450 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RorcP51450 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RorcP51450 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RorcP51450 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RorcP51450 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RorcP51450 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RorcP51450 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RorcP51450 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RorcP51450 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RorcP51450 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RorcP51450 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RorcP51450 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RorcP51450 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RorcP51450 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RorcP51450 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RorcP51450 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RorcP51450 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms