Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl5P50228 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl5P50228 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl5P50228 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl5P50228 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl5P50228 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl5P50228 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cxcl5P50228 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cxcl5P50228 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl5P50228 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl5P50228 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl5P50228 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl5P50228 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl5P50228 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl5P50228 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl5P50228 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl5P50228 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl5P50228 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl5P50228 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl5P50228 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl5P50228 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl5P50228 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl5P50228 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl5P50228 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl5P50228 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl5P50228 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl5P50228 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl5P50228 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cxcl5P50228 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl5P50228 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl5P50228 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl5P50228 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl5P50228 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl5P50228 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl5P50228 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cxcl5P50228 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cxcl5P50228 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl5P50228 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcl5P50228 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl5P50228 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl5P50228 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxcl5P50228 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl5P50228 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl5P50228 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl5P50228 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl5P50228 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl5P50228 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl5P50228 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl5P50228 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl5P50228 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms