Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tulp2P46686 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Tulp2P46686 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tulp2P46686 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tulp2P46686 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tulp2P46686 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tulp2P46686 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tulp2P46686 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tulp2P46686 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tulp2P46686 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tulp2P46686 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tulp2P46686 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tulp2P46686 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tulp2P46686 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tulp2P46686 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tulp2P46686 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tulp2P46686 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tulp2P46686 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tulp2P46686 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Tulp2P46686 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tulp2P46686 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tulp2P46686 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tulp2P46686 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tulp2P46686 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tulp2P46686 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tulp2P46686 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tulp2P46686 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tulp2P46686 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tulp2P46686 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tulp2P46686 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tulp2P46686 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tulp2P46686 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tulp2P46686 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tulp2P46686 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tulp2P46686 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tulp2P46686 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tulp2P46686 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tulp2P46686 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tulp2P46686 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp2P46686 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tulp2P46686 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tulp2P46686 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tulp2P46686 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tulp2P46686 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tulp2P46686 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Tulp2P46686 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp2P46686 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tulp2P46686 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tulp2P46686 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tulp2P46686 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tulp2P46686 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tulp2P46686 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tulp2P46686 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tulp2P46686 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tulp2P46686 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tulp2P46686 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tulp2P46686 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tulp2P46686 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tulp2P46686 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp2P46686 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tulp2P46686 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tulp2P46686 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tulp2P46686 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tulp2P46686 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp2P46686 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp2P46686 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tulp2P46686 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp2P46686 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tulp2P46686 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tulp2P46686 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tulp2P46686 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tulp2P46686 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tulp2P46686 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tulp2P46686 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tulp2P46686 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms