Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Lig1P37913 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lig1P37913 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lig1P37913 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lig1P37913 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lig1P37913 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lig1P37913 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lig1P37913 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lig1P37913 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lig1P37913 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lig1P37913 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lig1P37913 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Lig1P37913 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lig1P37913 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lig1P37913 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lig1P37913 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lig1P37913 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lig1P37913 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lig1P37913 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lig1P37913 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lig1P37913 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lig1P37913 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lig1P37913 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Lig1P37913 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lig1P37913 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lig1P37913 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lig1P37913 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lig1P37913 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lig1P37913 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lig1P37913 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lig1P37913 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lig1P37913 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lig1P37913 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lig1P37913 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lig1P37913 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lig1P37913 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lig1P37913 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lig1P37913 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lig1P37913 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lig1P37913 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lig1P37913 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lig1P37913 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lig1P37913 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lig1P37913 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lig1P37913 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lig1P37913 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lig1P37913 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lig1P37913 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lig1P37913 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lig1P37913 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lig1P37913 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lig1P37913 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lig1P37913 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Lig1P37913 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lig1P37913 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lig1P37913 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lig1P37913 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lig1P37913 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lig1P37913 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lig1P37913 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lig1P37913 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lig1P37913 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lig1P37913 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lig1P37913 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lig1P37913 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lig1P37913 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lig1P37913 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lig1P37913 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lig1P37913 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lig1P37913 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lig1P37913 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lig1P37913 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lig1P37913 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lig1P37913 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lig1P37913 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lig1P37913 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lig1P37913 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lig1P37913 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lig1P37913 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lig1P37913 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lig1P37913 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lig1P37913 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lig1P37913 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lig1P37913 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lig1P37913 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lig1P37913 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lig1P37913 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Lig1P37913 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lig1P37913 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lig1P37913 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lig1P37913 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lig1P37913 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms