Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sar1aP36536 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sar1aP36536 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sar1aP36536 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sar1aP36536 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sar1aP36536 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sar1aP36536 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sar1aP36536 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sar1aP36536 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sar1aP36536 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sar1aP36536 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sar1aP36536 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sar1aP36536 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sar1aP36536 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sar1aP36536 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sar1aP36536 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sar1aP36536 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sar1aP36536 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sar1aP36536 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sar1aP36536 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sar1aP36536 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sar1aP36536 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sar1aP36536 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sar1aP36536 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sar1aP36536 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sar1aP36536 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sar1aP36536 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sar1aP36536 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sar1aP36536 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sar1aP36536 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sar1aP36536 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sar1aP36536 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sar1aP36536 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sar1aP36536 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sar1aP36536 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sar1aP36536 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sar1aP36536 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sar1aP36536 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sar1aP36536 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sar1aP36536 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sar1aP36536 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sar1aP36536 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sar1aP36536 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms