Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfc1P35601 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfc1P35601 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfc1P35601 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfc1P35601 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfc1P35601 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfc1P35601 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfc1P35601 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rfc1P35601 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rfc1P35601 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rfc1P35601 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rfc1P35601 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rfc1P35601 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rfc1P35601 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rfc1P35601 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rfc1P35601 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rfc1P35601 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rfc1P35601 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rfc1P35601 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rfc1P35601 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rfc1P35601 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rfc1P35601 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rfc1P35601 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfc1P35601 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfc1P35601 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rfc1P35601 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rfc1P35601 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rfc1P35601 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfc1P35601 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfc1P35601 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rfc1P35601 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfc1P35601 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfc1P35601 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfc1P35601 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rfc1P35601 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rfc1P35601 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rfc1P35601 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rfc1P35601 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rfc1P35601 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rfc1P35601 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rfc1P35601 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rfc1P35601 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rfc1P35601 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rfc1P35601 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rfc1P35601 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rfc1P35601 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rfc1P35601 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfc1P35601 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfc1P35601 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rfc1P35601 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rfc1P35601 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rfc1P35601 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rfc1P35601 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rfc1P35601 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rfc1P35601 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rfc1P35601 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rfc1P35601 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms