Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab17P35292 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab17P35292 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab17P35292 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab17P35292 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab17P35292 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab17P35292 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab17P35292 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab17P35292 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab17P35292 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab17P35292 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab17P35292 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab17P35292 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab17P35292 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab17P35292 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab17P35292 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab17P35292 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab17P35292 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab17P35292 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab17P35292 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab17P35292 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab17P35292 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab17P35292 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab17P35292 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab17P35292 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab17P35292 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab17P35292 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab17P35292 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab17P35292 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab17P35292 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab17P35292 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab17P35292 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab17P35292 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab17P35292 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab17P35292 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab17P35292 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab17P35292 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab17P35292 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab17P35292 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab17P35292 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab17P35292 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab17P35292 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab17P35292 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab17P35292 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab17P35292 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms