Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mmp12P34960 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mmp12P34960 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mmp12P34960 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp12P34960 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp12P34960 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp12P34960 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp12P34960 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp12P34960 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp12P34960 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp12P34960 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp12P34960 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp12P34960 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp12P34960 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp12P34960 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp12P34960 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp12P34960 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp12P34960 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp12P34960 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp12P34960 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp12P34960 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp12P34960 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp12P34960 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp12P34960 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp12P34960 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp12P34960 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp12P34960 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp12P34960 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp12P34960 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp12P34960 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp12P34960 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp12P34960 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp12P34960 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp12P34960 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp12P34960 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp12P34960 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp12P34960 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp12P34960 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp12P34960 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp12P34960 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp12P34960 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp12P34960 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp12P34960 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp12P34960 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp12P34960 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Mmp12P34960 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp12P34960 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp12P34960 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp12P34960 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp12P34960 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp12P34960 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp12P34960 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp12P34960 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp12P34960 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp12P34960 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp12P34960 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp12P34960 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp12P34960 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp12P34960 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp12P34960 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp12P34960 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp12P34960 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp12P34960 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp12P34960 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms